治療大腸直腸癌需考量多種因素，包括癌細胞的分期和位置、病人的身體狀況等等。一般來說，手術乃最典型的移除大腸癌細胞方法。但要注意的是，面對連手術也無法治療的複雜病例，患者康復的機率或許很小，醫師能做的只是控制症狀，減緩癌細胞的擴散。以下列出八種治療選擇：
大腸直腸癌：篩檢與診斷
1. 手術
不管病人處於大腸癌的哪一階段和分期，手術都是最常見的治療方法，而依照癌細胞擴散的程度，施行的手術也會有所不同，以下一一介紹。
早期癌細胞（小） 局部切除術：在大腸癌早期，癌細胞仍小且未擴散時，醫師可透過此手術移除癌細胞，並不會切割到腹壁。若移除的是息肉，則叫做息肉切除術（Polypectomy）。
晚期癌細胞（大）或複雜病況 開放性切除術：於腹中開大切口，並移除一部分大腸。 結腸部分切除術：在沒辦法移除息肉的狀況下，醫師可能會考慮施行此類手術。腹腔鏡手術（Laparoscopic surgery）是其中最常用的一種，藉由在腹壁開小切口，並將攝影儀器放入腹中，醫師會移除一部分的大腸，包含癌細胞和周邊健康細胞組織，接著再用吻合術（Anastomosis）將健康的大腸連接起來，同時，醫師也會一併移除鄰近的淋巴結，以便分析其有無癌細胞。 大腸造口術：倘若切割的大腸沒辦法被連接起來，醫師則會藉由此手術在腹壁外面開一個口，讓糞便能排出來。大腸造口術（Colostomy）可以是暫時性的，待大腸和直腸康復後，再做解除，但如果將下半部的大腸完全移除，它就是永久性了。 內視鏡黏膜切除術：類似結腸部分切除術。透過運用特殊儀器，此手術可移除較大的息肉，連同癌細胞和周邊健康細胞組織一起移除。 機器人輔助手術：屬於一種微創手術（Keyhole surgery，也叫鎖孔手術），透過儀器引導機器人，來幫助移除癌細胞。
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使用藥物殺死癌細胞，或停止其分裂過程，通常大腸癌的藥物會由不同的配方組成，使用方式可分為以下兩種，或也可能混合使用。 全身性化學治療：透過口服或靜脈注射，藥物可藉由血管觸及全身的癌細胞。 局部性化學治療：直接注入腦脊隨液、器官或體腔，藥物主要觸及該部位的癌細胞。
一般而言，化學治療希望達到的目的有以下三種： 於手術前使癌細胞縮小，可搭配放射治療。 於手術後殺死體內存留的癌細胞，並降低癌症復發的風險。 做為緩和性化學治療使用，緩化癌細胞的擴散，並幫助控制症狀。
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一種使用高能量輻射殺死癌細胞，或抑制其成長的治療方法，主要分為以下兩種： 體內放射治療：透過將放射性物質放入針、線、導管、種子等，然後置於癌細胞中，或靠近癌細胞之處。 體外放射治療：使用放射線治療儀器從體外發送輻射到體內癌細胞。可以用於緩和療護來舒緩症狀，提升生活品質。
4. 緩和療護
屬特別的醫療照護，著重在舒緩重病和癌症患者疼痛及症狀，它需要搭配其他治療策略。緩和療護團隊包括醫師和護理師、專業照護人員、病人及家庭成員，若施行得當，患者的病況可能逐漸好轉且活得更久。 5. 燒灼術和栓塞術
燒灼術（Ablation，或稱消融術）可殺死不超過四公分的腫瘤，如射頻燒灼術（Radiofrequency Ablation Therapy，簡稱 RFA）可透過高溫摧毀腫瘤細胞，無須透過手術切除；栓塞術（Embolization）則是阻絕或降低血液從肝流往癌細胞的過程，一般用以治療超過五公分的腫瘤，也可與摘除術一併進行。
這兩種手術可用於大腸癌轉移，小腫瘤出現於肝和肺中，或是作為無法進行切除術的替代方案，如下列三種狀況： 手術後的轉移型腫瘤 手術也無法治療癌症 其他因素無法接受手術治療
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6. 冷凍治療
藉由超低溫冷凍殺死不正常細胞組織和癌細胞，此治療方法被稱為冷凍治療（Cryosurgery）。為了觸及大腸的癌細胞，醫師會使用冷凍探頭，將液態氮或氬氣傳送到體內的癌細胞，使接觸的細胞結成冰晶，最後被身體所吸收和消化。 7. 標靶治療
通常會搭配化學治療使用，標靶治療（Targeted therapy，或作靶向治療）藉由藥物識別與精確攻擊癌細胞，阻絕細胞異常性及其生物運作過程，並不會傷害其他健康細胞。此療法通常會保留給進階或複雜型大腸癌使用，其可分為以下兩種進行方式： 單株抗體（Monoclonal antibodie）：藉由免疫系統細胞實驗培育而成，單株抗體能識別癌細胞內的助長物質，並將其殺死、阻絕其成長或避免癌細胞擴散。一般採注射方式進入患者體內，可單獨使用，或連同藥物、毒素、放射性物質注入癌細胞 血管新生抑制劑（Angiogenesis inhibitors）：抑制癌細胞上新生血管，阻絕血管成長所需的酵素、血管內皮生長因子，以及其他蛋白質，達到抑制癌細胞成長的效果。
（同場加映：精準打擊癌細胞！標靶治療的作用方式） 8. 免疫療法
以藥物治療啟動身體的免疫系統對抗癌症，藉由干擾癌細胞跟免疫細胞的結合，恢復與提升身體的自然防禦能力，此療法也被稱為生物療法（Biotherapy）。另外，免疫檢查點抑制劑（Immune checkpoint inhibitors）亦屬免疫療法，此治療通常會保留給晚期或複雜型大腸癌使用。